Mécanique moléculaire (champs de force). Méthodes de minimisation de l'énergie. Connexion (docking) moléculaire. Différentes méthodes de simulation : Monte Carlo et dynamique moléculaire. Solvant implicite et explicite. Conditions périodiques frontières. Recuite simulée (simulated annealing) et analyse conformationnelle. Applications pratiques des principes étudiés dans le cours. Un ordinateur portatif, régulièrement utilisé en classe, est requis pour suivre ce cours. L'étudiant qui a réussi le cours BIF-4000 ne peut s'inscrire à ce cours.
Mécanique moléculaire (champs de force). Méthodes de minimisation de l'énergie. Connexion (docking) moléculaire. Différentes méthodes de simulation : Monte Carlo et dynamique moléculaire. Solvant implicite et explicite. Conditions périodiques frontières. Recuite simulée (simulated annealing) et analyse conformationnelle. Applications pratiques des principes étudiés dans le cours. Un ordinateur portatif, régulièrement utilisé en classe, est requis pour suivre ce cours. L'étudiant qui a réussi le cours BIF-4000 ne peut s'inscrire à ce cours.
